GMI Imanuel bermula dari kerinduan beberapa jemaat Methodist yang merantau ke Jakarta untuk mendirikan Pos Pekabaran Injil Methodist di wilayah Angke, Jakarta Barat. Kerinduan ini terwujud di tahun 1968. Untuk pertama kalinya diadakan kebaktian di sebuah garasi mobil milik salah seorang jemaat di Jl. Samarasa I No. 20, Angke. Ketika itu jumlah jemaat ± 20 orang.

Oleh anugerah Tuhan, Pos PI Methodist ini terus bertumbuh baik kualitas maupun kuantitas. Pada tanggal 20 Juni 1976, gedung gereja pertama yang memuat ± 100 orang di Jl. Latumeten Gg. Rahayu I No. 7 ditahbiskan dan diberi nama GMI Jemaat Imanuel. Seiring dengan pertumbuhan jemaat, meski ruang kebaktian dan sekolah telah diperluas, daya tampung ruangan semakin hari semakin tidak memadai lagi, demikian pula dengan jumlah siswa-siswi PKMI Methodist yang terus bertambah dan lahan parkir yang terbatas. Oleh karena itu, dengan anugerah Tuhan, pada tahun 1992 berhasil dibeli sebidang tanah seluas ± 4.000 m2 di Jl. Terusan Bandengan Utara No. 91 AY (tempat yang hingga sekarang digunakan untuk gereja dan sekolah). Setelah melewati masa pembangunan yang cukup panjang maka pada tanggal 8 Mei 2004 gedung gereja ditahbiskan.

Sesuai dengan semangat pelayanan John Wesley yang memberi perhatian khusus bagi pendidikan dan evangelisasi/penginjilan, GMI Imanuel membuka sekolah yang dinamakan Perguruan Kristen Methodist Indonesia (PKMI) Imanuel, mulai dari TK/Kelompok Bermain (dibuka tahun 1977), SD (1978), SMP (1982), SMU (1990).  GMI Imanuel juga membuka pos-pos pelayanan   di Jakarta, Bogor, Semarang, Solo, Surabaya, Bali hingga Kalimantan (Pontianak, Singkawang, Sanggau Ledo dan daerah sekitarnya). Hingga kini GMI Imanuel telah membuka 30 Pos Pelayanan  , dan  di antaranya 11 pos pelayanan sudah menjadi jemaat dewasa ， juga membuka sekolah TK – SMA didaerah Kalimantan Barat . Biarlah Tuhan terus memakai GMI Imanuel menjadi penyalur berkat dan penyalur anugrah kasihNya.

Segala Kemulian Hanya Bagi Tuhan !

衛理以馬內利教會的起源，由几位从外地移居雅加達的衛理公會信徒，因他们有負擔渴望在西雅加達 Angke 地區成立一處衛理公會的布道所。這份渴望終於在 1968 年得以實現，首次崇拜會於 Angke 地區 Samarasa I 20 號的一處車庫中舉行，當時聚會人數約 20 人。

在主的恩典帶領下，這處布道所無論在質与量上都不斷成長。位於 Latumeten Rahayu I 巷 7 號、约可容納100 人的第一座教堂，在1976 年 6 月 20 日，正式獻堂，並命名為 衛理以馬內利教會。隨著會眾的迅速增長，即使禮拜堂與學校已多次擴建，仍無法滿足聚會與教育的需要，加上衛理基督教學校學生人數持續增加，以及停車空間有限，使得場地更加严重不足。

因此，在神的恩典帶領下，教會於 1992 年購得位於北班登岸延長路 91 AY 號、面積約 4,000 平方公尺的土地（即今日教會與學校所使用的地點）。經歷漫長的建築工程後，新堂於 2004 年 5 月 8 日正式獻堂使用。

秉持約翰・衛斯理重視教育與宣教的服事精神，衛理以馬內利教會創立了 印尼衛理基督教學校（PKMI），包括幼兒园（1977）、小學（1978）、國中（1982）、高中（1990）。此外，教會亦在雅加達、茂物、三寶瓏、Solo、泗水、峇里島以及加里曼丹（坤甸、山口洋、Sanggau Ledo 及周邊地區）開拓多處布道所。迄今，衛理以馬內利教會已設有 30 個事工站，其中 11 個已成熟自立，並在西加里曼丹地區也開辦從幼兒園至高中的教育機構。

願主繼續使用衛理以馬內利教會，成為祂恩典與祝福的管道。

一切榮耀唯獨歸於主！